Saat ini ia bermain untuk A N Prizren, mengenakan kaus bernomor 99. Di tingkat internasional, ia mewakili Kosovo U21. Ia bermain terutama sebagai Penjaga gawang. Kaki yang diutamakan adalah Kanan. Nilai pasar saat ini diperkirakan sebesar 200K €.

Perpindahan terakhirnya adalah dari FK Besa ke KF Dukagjini pada 2025-07-04.

Di Kualifikasi Kejuaraan Eropa U21 2023-2024, Egzon Lekaj bermain dalam 1 pertandingan, dengan rata-rata 0 intersepsi, 0 tekel, dan 0 sapuan per pertandingan.