Di tingkat internasional, ia mewakili Nikaragua. Ia bermain terutama sebagai Penyerang.

Pada musim Liga Primera Nikaragua 2026, Efraín Mejía mencetak 0 gol dan memberikan 0 assist dalam 7 penampilan, dengan rata-rata 0 gol per pertandingan dari 0 percobaan tembakan dan 0 tepat sasaran.