Actualmente juega para el CSD Municipal, con el dorsal 18. Juega principalmente en la posición de Defensor. Su pie preferido es el Derecho. Su valor de mercado actual se estima en 400K €.

Durante la temporada 2025-2026 de la Liga Nacional de Guatemala, jonathan franco participó en 26 partidos, con un promedio de 0 entradas, 0 intercepciones y 0 despejes por partido, además de bloquear 0 tiros por partido.